تأسست الأقسام الداخلية في كلية القلم الجامعة في عام 2018-2019 حيث تحتوي على سكن للطالبات في داخل مجمع سكني مؤمن يتوفر فيه جميع متطلبات السكن المثالي مع وجود مشرفة داخل السكن مع الطالبات تقوم بتنظيم اعمال السكن، وكذلك سكن خاص بالطلاب أيضا يتوفر فيه جميع مستلزمات المثالية للسكن وتوفر الكلية وسائل نقل من والى الأقسام الداخلية. وتقوم الكلية بصيانة وادامة الأقسام الداخلية بشكل مستمر وتهيئة جميع متطلبات السكن.